Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc12Q8K2L8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms