Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms