Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Polr1eQ8K202 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Polr1eQ8K202 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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