Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms