Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sh2d5Q8JZW5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms