Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Znf628Q8CJ78 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf628Q8CJ78 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms