Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms