Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upp2Q8CGR7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms