Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdkl1Q8CEQ0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms