Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc17Q8CE13 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms