Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc9Q8CDN9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc9Q8CDN9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms