Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cacnb2Q8CC27 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacnb2Q8CC27 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms