Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Samd4aQ8CBY1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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