Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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