Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ubqln3Q8C5U9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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