Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Q8C5C9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q8C5C9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms