Protein–RNA interactions for Protein: Q8C116

Fmo9, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo9Q8C116 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fmo9Q8C116 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Fmo9Q8C116 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fmo9Q8C116 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms