Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L0

Tmx4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx4Q8C0L0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmx4Q8C0L0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms