Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccser1Q8C0C4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccser1Q8C0C4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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