Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ythdf3Q8BYK6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms