Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam53cQ8BXQ8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms