Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrtm1Q8BXQ3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lrtm1Q8BXQ3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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