Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TtpaQ8BWP5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms