Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lmod1Q8BVA4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms