Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Pggt1bQ8BUY9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pggt1bQ8BUY9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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