Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp43Q8BUM9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Usp43Q8BUM9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp43Q8BUM9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms