Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubr7Q8BU04 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms