Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup54Q8BTS4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms