Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms