Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8BP99 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8BP99 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Q8BP99 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8BP99 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q8BP99 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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