Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gga3Q8BMI3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gga3Q8BMI3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms