Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra5Q8BHJ7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms