Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Best2Q8BGM5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms