Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrrtm2Q8BGA3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
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