Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Efr3aQ8BG67 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Efr3aQ8BG67 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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