Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ubp1Q811S7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Ubp1Q811S7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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