Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc172Q810N9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc172Q810N9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms