Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cracr2bQ80ZJ8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms