Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q80Y73 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q80Y73 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q80Y73 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q80Y73 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms