Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Atg2bQ80XK6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms