Protein–RNA interactions for Protein: Q80W99

Catsper3, Cation channel sperm-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper3Q80W99 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Catsper3Q80W99 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Catsper3Q80W99 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms