Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ttc29Q80VM3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc29Q80VM3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms