Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NischQ80TM9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
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