Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf7ipQ7TT18 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atf7ipQ7TT18 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atf7ipQ7TT18 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms