Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sgo2Q7TSY8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgo2Q7TSY8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms