Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
ClmQ7TSN2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms