Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ckap2lQ7TS74 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ckap2lQ7TS74 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms