Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfsf18Q7TS55 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfsf18Q7TS55 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tnfsf18Q7TS55 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tnfsf18Q7TS55 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsf18Q7TS55 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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