Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actn1Q7TPR4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Actn1Q7TPR4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms