Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Zfp397Q7TNK4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Zfp397Q7TNK4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms